Proyek ini dimulai pada tahun 2001: pada tahun 1999, kendali atas Terusan Panama dialihkan dari Amerika Serikat ke otoritas Panama, dan pada saat yang sama muncul pertanyaan tentang penggunaan baru wilayah yang berdekatan. Salah satu bagian - yang sebelumnya ditempati oleh pangkalan udara Amerika - dialokasikan untuk museum. Konstruksi dimulai pada tahun 2006, tetapi baru pada awal Oktober ini Biomuseo dibuka untuk umum - meskipun belum sepenuhnya: beberapa aula dan akuarium tidak akan siap hingga musim dingin 2016.
Dengan atap aluminiumnya yang berwarna-warni, museum ini harus mengingatkan pada alam Panama yang semarak, atap logam gubuk lokal, dan struktur bersejarah infrastruktur kanal. Terletak di semenanjung sempit yang menjorok ke teluk, bangunan ini terlihat dari jauh dan dengan sendirinya menawarkan pemandangan panorama kota dan "mulut" Pasifik Terusan Panama.
Lamanya pembangunan museum yang oleh penduduk setempat dijuluki "museum itu tidak akan pernah selesai", antara lain disebabkan oleh rendahnya kualifikasi para pembangun lokal. Beton kasar pada lantai dan dinding harus dituang berkali-kali, dan atap dengan toleransi 6 mm juga menimbulkan banyak kesulitan.
Namun, kini museum tersebut tidak hanya berhasil dibangun, tetapi hampir seluruhnya diisi dengan pameran "The Bridge of Life" yang dirancang oleh Bruce Mau. Lembaga Smithsonian di Washington bertanggung jawab atas sisi ilmiah proyek, dan Biomuseo menjadi satu-satunya museum mitra di luar Amerika Serikat.
Museum ini didedikasikan untuk keanekaragaman alam yang menakjubkan di Tanah Genting Panama: dengan luas 75.000 km2, museum ini adalah rumah bagi lebih banyak spesies burung, mamalia, reptil, dan tumbuhan daripada gabungan di Amerika Serikat dan Kanada. Selain itu, eksposisi menceritakan secara detail tentang proses pembentukan isthmus, yang dimulai 12 juta tahun lalu dan berakhir 3 juta tahun lalu. Penampilannya mengubah ekosistem dan iklim dalam skala planet: alih-alih samudra tunggal, Atlantik dan Pasifik yang sangat berbeda muncul, Arus Teluk "dimulai" dari Laut Karibia yang baru muncul, dan Amerika Utara dan Selatan bersatu untuk pertama kalinya dalam 70 juta tahun. Migrasi aktif hewan dimulai di sepanjang tanah genting, dan relatif baru-baru ini, 15.000 tahun yang lalu, orang pertama melewati rute ini dari utara ke selatan.
Biomuseo, yang menelan biaya $ 95 juta (belum termasuk biaya ruang pameran yang belum selesai), dirancang terutama untuk anak-anak sekolah (direncanakan untuk membawa 40.000 siswa setahun ke sana untuk tamasya gratis) dan untuk wisatawan, karena terminal kapal pesiar adalah sangat dekat. Idealnya, pihak berwenang mengharapkan "efek Bilbao" dari museum. Menurut rencana mereka, itu harus menjadi simbol yang sama dari kota Panama dan negara Panama, yang menjadi Opera House Utson untuk Sydney dan Australia.