Bangunan itu terletak di kaki batu tempat Akropolis berada. Karena kekhasan situs, itu berorientasi di sepanjang sumbu timur-barat, tetapi menempati seluruh atas, lantai tiga, Galeri Parthenon disebarkan secara tajam dalam kaitannya dengan volume utama bangunan dan menghadap ke utara. Ini tidak hanya memungkinkan untuk menyelesaikan sebagian masalah panas berlebih di iklim panas, tetapi juga secara visual menghubungkan aula dengan patung-patung yang pernah menghiasi fasad kuil besar, dengan Parthenon itu sendiri, yang terletak kurang dari 300 meter dari museum. Efek dinamis dari solusi ini memenuhi bangunan dengan energi; di sini kita dapat melihat makna simbolis tertentu: tampaknya beralih ke Akropolis, ke masa lalu, yang sesuai dengan pesan politik yang dimasukkan oleh pemerintah Yunani ke dalam gedung baru: mari kita putar kembali waktu dan mengembalikan monumen ke tempatnya. keadaan aslinya (atau setidaknya menyatukan semua bagiannya yang sekarang disimpan di London, Paris, Palermo, Roma).
Retorika semacam itu dapat memengaruhi proyek arsitektur: bahkan setelah kemenangan versi Chumi dalam kompetisi tahun 2001, ada banyak pendukung desain neoklasik bangunan museum di Yunani. Namun, volume kaca, beton dan marmer yang sangat rahasia memberikan latar belakang yang jauh lebih bijaksana untuk koleksi patung dari periode Archaic hingga zaman Romawi daripada semacam struktur "bersejarah".
Karena fakta bahwa sisa-sisa seperempat kota dari zaman kuno ditemukan di bawah bangunan, diputuskan untuk mengangkatnya di atas tanah pada 100 penyangga beton dengan "engsel", yang akan mengurangi getaran jika terjadi gempa bumi; Sekilas, mereka diatur secara acak, tetapi dalam kenyataannya - agar tidak merusak temuan arkeologis. Fondasi rumah kuno dapat dilihat melalui bukaan dan area kaca di lantai lantai dasar museum, di mana ruang depan dan aula pameran sementara berada. Dari sana, pengunjung naik ke lantai dua, tempat semua pameran dipamerkan, kecuali patung Parthenon, dan ada juga teras terbuka dengan kafe. Lantai tiga dengan "Galeri Parthenon" adalah ruang kaca persegi panjang, di tengahnya terdapat volume beton, mengulangi ukuran cella candi. Dekorasi terkenal dengan prosesi Panathenaic telah dibuat ulang di atasnya dari bagian dan gips asli.
Suasana serius dari "kuil seni" di museum akan terus berlanjut meskipun jumlah pengunjung yang diharapkan sangat banyak: kebisingan akan diserap oleh banyak lubang melingkar yang dibuat di dinding beton. Selain tidak adanya dekorasi apa pun, jumlah tanda dan label telah dikurangi seminimal mungkin: tidak ada yang mengganggu pameran. Rute yang dipikirkan dengan matang akan memfasilitasi pemeriksaan koleksi: dari penggalian arkeologi di bawah bangunan hingga patung kuno di lantai dua, lalu ke Galeri Parthenon di lantai tiga, dan kemudian ke karya Helenistik dan Periode Romawi.